آقاى حداد عادل رئیس مجلس شوراى اسلامى در نامهاى خطاب به مقام معظم رهبرى خواستار تجدید نظر شوراى نگهبان در بررسى صلاحیت کاندیداهاى انتخابات ریاست جمهورى شد. در نامه رئیس مجلس شوراى اسلامى آمده است، چنانکه تجدید نظر در این امر را به مصلحت و مایه تقویت مشارکت عمومى بیشتر - که مخصوصاً مورد عنایت حضرتعالى در انتخابات ریاست جمهورى بوده - مىدانید، شوراى محترم نگهبان را به توسیع دایره نامزدهاى واجد صلاحیت دلالت فرمائید. حضرت آیتاللَّه خامنهاى در پى نامه رئیس مجلس شوراى اسلامى، نامهاى خطاب به دبیر شوراى نگهبان مرقوم فرمودند.
حضرت آیت الله خامنه‌ای در نامه‌ای به حجت‌الاسلام والمسلمین کروبی رییس مجلس شورای اسلامی از همراهی وهمکاری مجاهدت آمیز ایشان در برگزاری بهنگام و قانونی انتخابات هفتمین دوره مجلس شورای اسلامی قدردانی کردند.
رهبر معظم انقلاب اسلامى در پاسخ به نامه مشترک آقایان خاتمى و کروبى روساى قواى مجریه و مقننه مبنى بر برگزارى انتخابات مجلس هفتم در روز اول اسفند تاکید کردند: تلاش مجدانه و عزم جدى شما براى برگزارى انتخابات در موعد مقرر به عنوان فریضه‌اى ملى و انقلابى موجب خرسندى است و ملت بزرگوار نیز از مسؤولان انتظار دارد با وحدت و همدلى اینگونه وظایف بزرگ را به بهترین و سالمترین وجه به انجام برسانند.
حجت‌الاسلام والمسلمین قمى مسؤول نهاد نمایندگى ولى فقیه در دانشگاهها و حجت‌الاسلام والسلمین ابوترابى مسؤول نهاد نمایندگى ولى فقیه در دانشگاه تهران در نامهاى به مقام معظم رهبرى با اشاره به اغتشاشات خردادماه و بازداشت شمارى از دانشجویان در این اغتشاشات، خواستار عطوفت و رأفت اسلامى نسبت به دانشجویانى که از اصحاب فتنه متمایز بودند، شدند.
رهبر معظم انقلاب اسلامى در پاسخ به پیام تشکر رئیس مجلس اعلاى انقلاب اسلامى عراق از ملت ایران و مسؤولان جمهورى اسلامى ایران، ابراز امیدوارى کردند همه قشرهاى مردم عراق با حفظ وحدت و یکپارچگى، هر چه زودتر شاهد آزادى کامل این کشور از سلطه بیگانگان و استقرار نظام مستقل مردم سالار باشند.
چهارده انجمن، گروه و مرکز علمى تحقیقاتى و دانشگاهى درنامهاى به رهبر معظم انقلاب اسلامى آمادگى خود را براى تلاش سازماندهى شده و منظم در جهت تحقق رهنمودهاى ایشان در زمینه ایجاد نهضت نرمافزارى و رشد و بالندگى علمى کشور اعلام کردند.
بسمه تعالی با سلام و تحیت و تبریک سالگرد پیروزی انقلاب اسلامی با پیشنهاد جنابعالی در باب عفو و تخفیف مجازات محکومان دادگاهها به ترتیبی که در سال گذشته مقرر گشته بود موافقم. والسلام علیکم و رحمه‌الله سید علی خامنه‌ای 09/12/1380
در پی نامه آقای کروبی رئیس مجلس شورای اسلامی به حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی درخصوص مالیات شرکتهای تحت پوشش نهادها و بنیادها، مقام معظم رهبری با لغو معافیت مالیاتی نهادها و بنیادها به شرح ذیل موافقت فرمودند:
بسم الله الرحمن الرحیم جناب حجت‌الاسلام آقای کروبی ریاست محترم مجلس شورای اسلامی با سلام و تحیت; اینجانب علی الاصول با لغو هرگونه امتیاز خاص برای نهادها و بنیادها موافقم. صرفا دغدغه‌ی هزینه‌های مأموریتی این دستگاهها مانند جانبازان عزیز و خانواده‌های معظم شهیدان و محرومان و مستضعفان ذهن اینجانب را مشغول می‌کند و اگر این امر بنحو مناسب در بودجه‌ی عمومی پیش‌بینی شود و این دستگاهها بویژه آموزشی و فرهنگی، در مورد ایفای وظایف خود دچار کمبود نشوند با لغو معافیت مالیاتی آنها موافقم و از آن حمایت می‌کنم. سیدعلی خامنه‌ای 15/10/1380
در پی نامه آقای سیدمحمدرضا خاتمی نائب رئیس و هیئت رئیسه مجلس شورای اسلامی به حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی درخصوص مشکلات اخیر چند نفر از نمایندگان، مقام معظم رهبری در نامه‌ای ضمن تأکید بر لزوم حفظ حرمت قوه قضاییه از جانب مجلس و نیز حفظ حرمت مجلس از جانب قوه قضاییه تصریح کردند: اینجانب نمایندگان محترم مجلس و نیز مسؤولان محترم قوه قضاییه را به پیمودن راههای قانونی و تمکین در برابر قانون و پرهیز از مجادله بیهوده در امری که مجرای قانونی آن مشخص است، دعوت می‌کنم.
جناب دکتر رمضان عبدالله دبیرکل حرکت جهاد اسلامی فلسطین با سلام و تحیت، پیام تبریک جنابعالی را به مناسبت پیروزی بزرگ ملت لبنان که به برکت مجاهدت جوانان مخلص حزب الله و مقاومت اسلامی تحقق یافته است دریافت کردم. در حقیقت این پیروزی متعلق به همه‌ی کسانی است که ایمان و عزم خود را بر مبارزه با صهیونیستهای غاصب حفظ کرده و وسوسه‌ی سازش و تسلیم در برابر دشمن عنود و زیاده خواه را به دل راه نداده‌اند.
حضرت آیت الله خامنه ای، رهبر معظم انقلاب اسلامی روز 28 اسفند 78 در نامه ای خطاب به رئیس جمهور ، با ابراز نگرانی از آینده ی امنیت کشور، ضمن اشاره به روند کند پیگیری پرونده قتلهای زنجیره ای، بر رسیدگی جدی به پرونده ی اتفاقات اخیر، در مدت معینی تأکید فرمودند.
حضرت آیت‌الله خامنهاى رهبر معظم انقلاب اسلامى در پاسخ به نامه جمعى از نمایندگان مجلس شوراى اسلامى در مورد حل مشکل غلامحسین کرباسچى، نامهاى بدین شرح صادر فرمودند:
حضرت آيت الله خامنه‌اي رهبر معظم انقلاب اسلامي از خيرين مدرسه ساز در سراسر كشور، تقدير و تشكر كردند و طي دستوري كليه املاك تحت تملك بنياد مستضعفان و جانبازان انقلاب اسلامي كه از آنها به عنوان محل آموزشي استفاده مي شود را به وزارت آموزش و پرورش به صورت رايگان واگذار فرمودند.
رهبر عزيزم، مرجع و مرادم حضرت آيت ا... خامنه‌اي با سلام احتراماً من نو جواني 14 ساله و مقلد شما هستم كه تازه به سن تكليف رسيده‌ام،آرزوي ديدار شما را داشتم.
حجت‌الاسلام والمسلمین خاتمى رئیس جمهورى، در نامهاى به محضر حضرت آیت‌الله خامنهاى رهبر معظم انقلاب اسلامى، از معظمله خواستار شد که رهنمودهاى خود را در مورد طرح ساماندهى اقتصاد جمهورى اسلامى عنایت فرمایند تا منشاء خیر و اطمینان در جامعه و راهگشا براى خدمتگزاران نظام و مردم باشد.
من محمد صابر هستم؛ فرزند 12 ساله‌ي فرزند سردار جهادگر شهيد، حاج محمد حسن ناصر بخت، آقا نمي‌دانيد چه‌قدر منتظر آمدنتان بودم: اما متأسفانه پام شكسته، ديروز لنگان لنگان به استقبالتان آمدم: خيلي هم راه آمدم.
در پى دیدار شرکت کنندگان ششمین کنگره جهانى زرتشتیان با حضرت آیت‌الله خامنهاى رهبر معظم انقلاب اسلامى، رئیس این کنگره با ارسال نامهاى به محضر معظمله، ضمن تشکر و قدردانى از همکاریهاى ارزنده مسؤولان نظام جمهورى اسلامى ایران در برگزارى ششمین کنگره جهانى زرتشتیان در ایران، از توفیق دیدار نمایندگان انجمنهاى زرتشتى سراسر جهان و اقشار جامعه زرتشتى با حضرت آیت‌الله خامنهاى سپاسگزارى کرده است .
