إثر رحيل الفقيه المجاهد المرحوم المغفور له آية الله الشيخ محمد فاضل اللنكراني «رضوان الله تعالى عليه» وجه ولي أمر المسلمين سماحة آية الله العظمى السيد علي الخامنئي رسالة تعزية فيما يلي نصّها:

بسم الله الرحمن الرحيم
إنا لله وإنا اليه راجعون
ببالغ الحزن والأسى تلقيت نبأ رحيل الفقيه المجاهد المرحوم المغفور له آية الله الشيخ فاضل اللنكراني «رضوان الله تعالى عليه».
إنها لخسارة عظيمة للحوزة العلمية وللشعب الإيراني الكريم.
لقد فقدت الحوزة العلمية أحد أساطينها العلمية والتحقيقية وأحد أساتذتها البارزين كما أن الشعب الإيراني قد فقد أحد مراجع تقليده الثوريين الواعين الناشطين.
لقد كان رحمه الله خلال سنوات المحنة الطوال أحد الشخصيات البارزة في الحوزات العلمية الذين سجلوا حضوراً في كافة ميادين الجهاد وتَحَمَّلَ مشاق المنفى، وبعد انتصار الثورة الإسلامية أيضاً كان من جملة رجال الدين المعروفين الذين اضطلعوا بدور مهم في جميع المرافق الحساسة. فليتغمده الله برحمته.
أنا بدوري أقدم تعازي بهذه المصيبة العظيمة إلى صاحب العصر والزمان (أرواحنا فداه) وإلى المراجع العظام والعلماء الأعلام وفضلاء وطلبة الحوزة المباركة والشعب الإيراني عامة.
كما أقدم التعازي لعائلته وأبنائه المكرمين وباقي أقربائه وذوية داعياً المولى العلي القدير أن يمن عليهم بالصبر والسلوان.

والسلام على عباد الله الصالحين
سيد علي الخامنئي
1 جمادى الثانية 1428هـ