رهبر انقلاب اسلامی در پی شهادت حجتالاسلام سید اسماعیل خطیب پیامی صادر کردند. متن پیام حضرت آیتالله سید مجتبی خامنهای،خطاب به آقای مسعود پزشکیان، رئیس جمهور در پی شهادت حجتالاسلام سید اسماعیل خطیب وزیر اطلاعات در تجاوز نظامی آمریکا و رژیم صهیونیستی به شرح زیر است:
بسم الله الرّحمن الرّحیم
رئیسجمهوری محترم، جناب آقای پزشکیان دامَتحِفاظَتُه و زیدَ عِزُّه
بعدَ التّحیه والسلام؛ بدینوسیله شهادت وزیر پرتلاش اطلاعات و جانباز گمنام باسابقه، حجتالاسلام سید اسماعیل خطیب رضوانالله تعالیعلیه را به جنابعالی و هیئت محترم دولت و همکاران آنجناب در وزارت اطلاعات و بالخصوص به خانواده آن بزرگوار تبریک و تسلیت عرض میکنم.
بیشک جای خالی ایشان باید با تلاش مضاعف دیگر مسئولین و کارکنان آن وزارتخانه حساس جبران شود و امنیت از دشمنان داخلی و خارجی سلب و به عموم هموطنان ارزانی گردد. از خداوند منان، بقاء جنابعالی و سائر همکاران و علوّ مقام برای آن شهید عزیز را خواستارم.
سیّد مجتبیٰ حسینی خامنهای